Bindningarna mellan vätet och syret i molekylen är kovalenta vilket innebär att de delar på elektroner för att var för sig få stabila konstruktioner. Elektronerna är negativt laddade och eftersom de är mer förskjutna mot syret än mot vätet så blir syreatomen negativt laddad och väteatomerna positivt laddade. Vatten molekylens ena ände blir därmed positivt laddad (pluspol) och den andra negativt laddad (minuspol). 

Vatten är en 'två-polad' molekyl - en dipol. 

Minuspolen i en vattenmolekyl attraheras av pluspolen i en annan molekyl och de krafter som håller samman molekylerna i ämnet vatten kallar man - vätebindningar. 

Vattnets egenskaper är unika jämfört med andra ämnen av liknande storlek. Förmågan att lösa andra ämnen är mycket god vilket beror på molekylens struktur och vätebindningarna mellan molekylerna.